Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms