Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY2Q8WXA3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms