Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIEQ8NEW7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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