Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDH2

CCDC168, Coiled-coil domain-containing protein 168, humanhuman

Predictions only

Length 2,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC168Q8NDH2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC168Q8NDH2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms