Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC82Q8N4S0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms