Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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