Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms