Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3HQ6NTF7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3HQ6NTF7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms