Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLX4IPQ5VYV7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms