Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms