Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A3Q5K4L6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms