Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P5Q59GN2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms