Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVEP1Q4LDE5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms