Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms