Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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