Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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