Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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