Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDK4Q16654 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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