Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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