Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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