Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RYR3Q15413 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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