Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms