Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK13Q14004 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
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