Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOFQ13790 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOFQ13790 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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