Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL4BQ13620 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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