Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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PEX6Q13608 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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