Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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