Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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GRIK3Q13003 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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