Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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FOXC1Q12948 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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FOXC1Q12948 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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FOXC1Q12948 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXC1Q12948 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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