Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCAPQ12770 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms