Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms