Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
PSME1Q06323 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSME1Q06323 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms