Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN12Q05209 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms