Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPCQ01831 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPCQ01831 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPCQ01831 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPCQ01831 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPCQ01831 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPCQ01831 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPCQ01831 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPCQ01831 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPCQ01831 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPCQ01831 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPCQ01831 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPCQ01831 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPCQ01831 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPCQ01831 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPCQ01831 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPCQ01831 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
XPCQ01831 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
XPCQ01831 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
XPCQ01831 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
XPCQ01831 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
XPCQ01831 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPCQ01831 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms