Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms