Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC42EP1Q00587 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms