Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMF1P82094 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TMF1P82094 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMF1P82094 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMF1P82094 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMF1P82094 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms