Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AQP4P55087 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AQP4P55087 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AQP4P55087 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AQP4P55087 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AQP4P55087 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AQP4P55087 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AQP4P55087 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AQP4P55087 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AQP4P55087 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AQP4P55087 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AQP4P55087 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AQP4P55087 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AQP4P55087 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AQP4P55087 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms