Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRAP54198 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRAP54198 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRAP54198 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRAP54198 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRAP54198 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRAP54198 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRAP54198 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
HIRAP54198 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIRAP54198 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIRAP54198 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIRAP54198 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIRAP54198 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIRAP54198 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIRAP54198 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIRAP54198 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRAP54198 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRAP54198 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRAP54198 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRAP54198 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRAP54198 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRAP54198 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRAP54198 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRAP54198 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRAP54198 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRAP54198 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRAP54198 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRAP54198 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRAP54198 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms