Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACLYP53396 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACLYP53396 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACLYP53396 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms