Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DAP3P51398 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DAP3P51398 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DAP3P51398 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms