Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms