Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNPDA1P46926 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms