Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDIT3P35638 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms