Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP6P35125 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP6P35125 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP6P35125 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP6P35125 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP6P35125 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP6P35125 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP6P35125 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP6P35125 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP6P35125 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP6P35125 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP6P35125 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP6P35125 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP6P35125 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP6P35125 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP6P35125 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP6P35125 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP6P35125 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP6P35125 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms