Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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CASQ1P31415 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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CASQ1P31415 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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CASQ1P31415 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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CASQ1P31415 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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CASQ1P31415 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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CASQ1P31415 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASQ1P31415 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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