Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPS1P31327 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPS1P31327 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPS1P31327 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPS1P31327 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPS1P31327 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPS1P31327 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPS1P31327 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPS1P31327 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPS1P31327 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPS1P31327 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPS1P31327 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPS1P31327 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPS1P31327 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CPS1P31327 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CPS1P31327 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPS1P31327 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CPS1P31327 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPS1P31327 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CPS1P31327 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPS1P31327 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms