Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1P23443 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1P23443 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms