Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX58O95786 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX58O95786 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX58O95786 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX58O95786 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX58O95786 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX58O95786 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX58O95786 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX58O95786 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX58O95786 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX58O95786 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX58O95786 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX58O95786 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX58O95786 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX58O95786 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX58O95786 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms