Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MBD4O95243 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MBD4O95243 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD4O95243 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD4O95243 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD4O95243 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD4O95243 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD4O95243 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD4O95243 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms